moonwalker72: (Ichirohiko)
[personal profile] moonwalker72
Хотел на Cent OS 6.5 собрать Clasp - средство молекулярного дизайна с помощью своего ЯВУ. Мне интересны модели белков, и что он там позволяет на них посмотреть.

Хрена. Ему нужен llvm-3.6.0, которого для этой версии ядра разумеется собранного нет. Для 3.6.0 есть src rpm. Поднял ядро до 6.8, затем получил много фана, пытаясь добиться видимости gcc 4.8 установленном в альтернативном devtoolset-2. Но rpmbuild его хоть убей не видит. Кажется всё доломал. Подумаю не снести ли виртуалку и не поставить ли сразу Cent OS 7.

Date: 2016-09-11 09:49 pm (UTC)
From: [identity profile] left-element.livejournal.com
Извиняюсь, а сделать make никак?

Date: 2016-09-12 07:09 am (UTC)
From: [identity profile] jescid.livejournal.com
А зачем именно с CentOS мучиться? Там даже пайтон без плясок с бубном не обновишь. Одна из самых дурно поддерживаемых систем.

Date: 2016-09-12 07:34 am (UTC)
From: [identity profile] moonwalker72.livejournal.com
Они его (Clasp) на OpenSuSe собирали. Она тоже RPM-ная, а CentOS я себе давно для других целей ставил на виртуалку. Подумал, что как-нить да проскочит. Но шиш.

Date: 2016-09-12 07:56 am (UTC)
From: [identity profile] jescid.livejournal.com
Clasp — это имя протеина.
А софта по теме — дофига и больше.

Date: 2016-09-12 08:04 am (UTC)
From: [identity profile] moonwalker72.livejournal.com
Я просто на YouTube увидел презентацию и стало интересно (он написан на Common Lisp и C++). Софта дофига, но большая часть - коммерческая и очень дорогая. В процессе обучения я поигрался с PyMOL - бесплатно он есть только в исходниках, а учебная лицензия ограничивает функционал.

Date: 2016-09-12 08:39 am (UTC)
From: [identity profile] moonwalker72.livejournal.com
Самые прокачанные - за денюжку.

Я наверное OpenSuse поставлю, тем более сами авторы Clasp на нем успешно собирали. Мне он интересен, как вариант HDL только для протеинов. Для бактериальных генов такой HDL уже есть.

Date: 2016-09-12 09:46 am (UTC)
From: [identity profile] jescid.livejournal.com
Для посмотреть прокачанность вам там точно не нужна, к тому же ею надо ещё уметь пользоваться.

Profile

moonwalker72: (Default)
moonwalker72

June 2017

S M T W T F S
    123
45678910
1112 1314151617
18192021222324
252627282930 

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jun. 17th, 2025 08:47 am
Powered by Dreamwidth Studios