(no subject)

Ища другое (про ускорение на FPGA) нашел на Хабре совсем недавнюю (конец ноября) работу об ускоренном моделировании динамики сборки микротрубочек. Правда там по существу рассматривается обратный процесс - деполимеризация, т.е. организация рассыпания микротрубочки на тубулины по мере энергопитательного расхода фосфора в присоедниненных молекулах ГТФ. Сама модель - не квантовомеханическая, основана на чистой термодинамике и использует подход "силовых полей", то есть граничными условиями (в том числе) являются градиенты связи тубулинов с соседями. Это любопытно, потому что шаг времени в модели - 0.2нс, характерное расстояние - 2 нм, на котором взаимодействие Ферстера продолжает иметь место.

Боюсь, что модель сама по себе - является все же больше феноменологической, чем количественной. Она рассматривает только собственные потенциалы тубулинов и, уж верно, не объясняет самосборку трубочки из тубулинов под действием микроволн и едва ли сможет объяснить эффективную перестройку всего цитоскелета за микросекунду, при этом разумеется микротрубочки не рассыпались - это происходило с отдельными, скрепляющими участками (точнее даже микрофиламентами), но это происходило согласованно и "мгновенно", что без квантов объяснить не выйдет. Но сама работа по любому - очень интересная.

Я тут ищу, рою статьи по теме связи цитоскелета с ионными проводимостями в нейроне. Я тут перешел к Capstone в Project System Biology Course. И мне хоцца ответить именно _на этот_ вопрос, потому что там вопрос можно выбрать по желанию.