moonwalker72: (Ichirohiko)
[personal profile] moonwalker72
Ища другое (про ускорение на FPGA) нашел на Хабре совсем недавнюю (конец ноября) работу об ускоренном моделировании динамики сборки микротрубочек. Правда там по существу рассматривается обратный процесс - деполимеризация, т.е. организация рассыпания микротрубочки на тубулины по мере энергопитательного расхода фосфора в присоедниненных молекулах ГТФ. Сама модель - не квантовомеханическая, основана на чистой термодинамике и использует подход "силовых полей", то есть граничными условиями (в том числе) являются градиенты связи тубулинов с соседями. Это любопытно, потому что шаг времени в модели - 0.2нс, характерное расстояние - 2 нм, на котором взаимодействие Ферстера продолжает иметь место.

Боюсь, что модель сама по себе - является все же больше феноменологической, чем количественной. Она рассматривает только собственные потенциалы тубулинов и, уж верно, не объясняет самосборку трубочки из тубулинов под действием микроволн и едва ли сможет объяснить эффективную перестройку всего цитоскелета за микросекунду, при этом разумеется микротрубочки не рассыпались - это происходило с отдельными, скрепляющими участками (точнее даже микрофиламентами), но это происходило согласованно и "мгновенно", что без квантов объяснить не выйдет. Но сама работа по любому - очень интересная.

Я тут ищу, рою статьи по теме связи цитоскелета с ионными проводимостями в нейроне. Я тут перешел к Capstone в Project System Biology Course. И мне хоцца ответить именно _на этот_ вопрос, потому что там вопрос можно выбрать по желанию.
From:
Anonymous( )Anonymous This account has disabled anonymous posting.
OpenID( )OpenID You can comment on this post while signed in with an account from many other sites, once you have confirmed your email address. Sign in using OpenID.
User
Account name:
Password:
If you don't have an account you can create one now.
Subject:
HTML doesn't work in the subject.

Message:

 
Notice: This account is set to log the IP addresses of everyone who comments.
Links will be displayed as unclickable URLs to help prevent spam.

Profile

moonwalker72: (Default)
moonwalker72

June 2017

S M T W T F S
    123
45678910
1112 1314151617
18192021222324
252627282930 

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jul. 24th, 2017 04:46 pm
Powered by Dreamwidth Studios